富士通杯獎金和對局費調整過兩次。首屆冠軍獎金1500萬日元(以下單位同)，亞軍500萬，第三名300萬，第四名150萬，八強80萬，第2輪對局費48萬，首輪對局費24萬。從第2屆至第15屆，冠軍獎金2000萬，亞軍700萬，第3名400萬，第4名200萬，八強100萬，第2輪60萬，首輪30萬。

　　亞洲金融風暴后，富士通壓縮開支，從第16屆至今重新沿用首屆比賽獎金和對局費制。

　　前20屆比賽，參賽次數達17次的曹薰鉉獲三次冠軍、一次亞軍，一次第3，一次第4，再加上几次前八，獎金加對局費共計7974萬日元，居所有棋手之首。排名第2的是同樣17次參賽的劉昌赫，他以兩屆冠軍，兩屆亞軍，一次第3，一次第4和兩次前八的戰績共獲7178萬日元。

　　李昌鎬以兩屆冠軍，兩屆亞軍，一次第3，一次第4，三次八強共獲6258萬日元。李世石獲三屆冠軍，但參賽次數不多，只能以5276萬日元排在第4。

　　中國棋手中，參賽次數最多的是馬曉春九段(14次)，曾獲一屆冠軍，兩屆亞軍，一屆第3，一屆第4，再加上几屆進入前八，以4590萬日元排在第5。

　　日本棋手排名最高的是林海峰，他11次參加富士通杯，1次冠軍，2次亞軍，共獲4410萬日元。